Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPARDQ03181 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARDQ03181 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms