Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA6Q01524 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms