Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD1P98174 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD1P98174 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD1P98174 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD1P98174 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD1P98174 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD1P98174 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD1P98174 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD1P98174 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD1P98174 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD1P98174 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD1P98174 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD1P98174 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD1P98174 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD1P98174 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD1P98174 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD1P98174 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD1P98174 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD1P98174 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD1P98174 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD1P98174 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD1P98174 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD1P98174 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD1P98174 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD1P98174 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD1P98174 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD1P98174 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD1P98174 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FGD1P98174 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FGD1P98174 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FGD1P98174 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FGD1P98174 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD1P98174 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD1P98174 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD1P98174 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD1P98174 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD1P98174 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD1P98174 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD1P98174 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD1P98174 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD1P98174 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD1P98174 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD1P98174 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD1P98174 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD1P98174 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD1P98174 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD1P98174 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD1P98174 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD1P98174 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD1P98174 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD1P98174 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD1P98174 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD1P98174 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD1P98174 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD1P98174 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms