Protein–RNA interactions for Protein: P82979

SARNP, SAP domain-containing ribonucleoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARNPP82979 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SARNPP82979 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARNPP82979 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARNPP82979 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARNPP82979 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARNPP82979 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARNPP82979 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARNPP82979 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARNPP82979 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARNPP82979 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARNPP82979 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARNPP82979 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARNPP82979 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARNPP82979 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SARNPP82979 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARNPP82979 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARNPP82979 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARNPP82979 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARNPP82979 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARNPP82979 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARNPP82979 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARNPP82979 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SARNPP82979 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARNPP82979 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SARNPP82979 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARNPP82979 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARNPP82979 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARNPP82979 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARNPP82979 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARNPP82979 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARNPP82979 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARNPP82979 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARNPP82979 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SARNPP82979 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARNPP82979 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SARNPP82979 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SARNPP82979 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARNPP82979 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARNPP82979 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARNPP82979 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARNPP82979 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARNPP82979 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARNPP82979 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SARNPP82979 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARNPP82979 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARNPP82979 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARNPP82979 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARNPP82979 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARNPP82979 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARNPP82979 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARNPP82979 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARNPP82979 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARNPP82979 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARNPP82979 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SARNPP82979 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SARNPP82979 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARNPP82979 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARNPP82979 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARNPP82979 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARNPP82979 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARNPP82979 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SARNPP82979 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARNPP82979 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARNPP82979 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARNPP82979 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARNPP82979 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SARNPP82979 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SARNPP82979 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms