Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms