Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF138P52744 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF138P52744 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms