Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms