Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PSEN1P49768 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms