Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF5P43026 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF5P43026 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF5P43026 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF5P43026 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF5P43026 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF5P43026 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF5P43026 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF5P43026 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF5P43026 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF5P43026 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF5P43026 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF5P43026 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF5P43026 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF5P43026 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF5P43026 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF5P43026 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF5P43026 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF5P43026 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF5P43026 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF5P43026 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF5P43026 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF5P43026 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF5P43026 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF5P43026 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF5P43026 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF5P43026 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms