Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNFRSF8P28908 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF8P28908 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms