Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCM3P25205 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCM3P25205 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCM3P25205 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCM3P25205 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCM3P25205 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCM3P25205 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCM3P25205 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCM3P25205 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCM3P25205 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCM3P25205 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCM3P25205 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCM3P25205 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCM3P25205 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCM3P25205 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCM3P25205 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCM3P25205 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCM3P25205 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCM3P25205 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCM3P25205 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCM3P25205 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCM3P25205 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCM3P25205 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM3P25205 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM3P25205 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM3P25205 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM3P25205 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM3P25205 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM3P25205 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM3P25205 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM3P25205 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM3P25205 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM3P25205 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM3P25205 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM3P25205 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCM3P25205 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM3P25205 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM3P25205 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM3P25205 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM3P25205 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM3P25205 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM3P25205 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM3P25205 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCM3P25205 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCM3P25205 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCM3P25205 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms