Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLDCP23378 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLDCP23378 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLDCP23378 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLDCP23378 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLDCP23378 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLDCP23378 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLDCP23378 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLDCP23378 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLDCP23378 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLDCP23378 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLDCP23378 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLDCP23378 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLDCP23378 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLDCP23378 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLDCP23378 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLDCP23378 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLDCP23378 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLDCP23378 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLDCP23378 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLDCP23378 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLDCP23378 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLDCP23378 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLDCP23378 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLDCP23378 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLDCP23378 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLDCP23378 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLDCP23378 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLDCP23378 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLDCP23378 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLDCP23378 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GLDCP23378 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLDCP23378 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLDCP23378 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLDCP23378 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLDCP23378 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLDCP23378 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLDCP23378 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLDCP23378 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLDCP23378 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLDCP23378 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLDCP23378 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLDCP23378 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLDCP23378 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLDCP23378 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLDCP23378 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GLDCP23378 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLDCP23378 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLDCP23378 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLDCP23378 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLDCP23378 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLDCP23378 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLDCP23378 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLDCP23378 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GLDCP23378 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLDCP23378 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLDCP23378 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLDCP23378 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLDCP23378 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLDCP23378 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLDCP23378 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLDCP23378 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLDCP23378 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLDCP23378 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLDCP23378 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLDCP23378 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms