Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM1P11229 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM1P11229 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms