Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CST1P01037 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CST1P01037 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CST1P01037 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CST1P01037 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CST1P01037 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CST1P01037 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CST1P01037 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST1P01037 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CST1P01037 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CST1P01037 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CST1P01037 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CST1P01037 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CST1P01037 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CST1P01037 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CST1P01037 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CST1P01037 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CST1P01037 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CST1P01037 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CST1P01037 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CST1P01037 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CST1P01037 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST1P01037 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST1P01037 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST1P01037 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST1P01037 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST1P01037 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST1P01037 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST1P01037 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST1P01037 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST1P01037 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CST1P01037 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST1P01037 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST1P01037 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST1P01037 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST1P01037 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST1P01037 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST1P01037 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST1P01037 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST1P01037 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST1P01037 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST1P01037 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST1P01037 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST1P01037 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST1P01037 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST1P01037 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST1P01037 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST1P01037 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST1P01037 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST1P01037 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST1P01037 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST1P01037 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST1P01037 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST1P01037 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST1P01037 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST1P01037 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST1P01037 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST1P01037 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CST1P01037 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST1P01037 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST1P01037 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST1P01037 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST1P01037 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST1P01037 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST1P01037 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST1P01037 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST1P01037 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST1P01037 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST1P01037 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST1P01037 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms