Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALDH1A2O94788 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms