Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SART1O43290 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SART1O43290 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SART1O43290 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SART1O43290 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SART1O43290 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SART1O43290 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SART1O43290 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SART1O43290 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SART1O43290 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SART1O43290 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SART1O43290 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SART1O43290 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SART1O43290 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SART1O43290 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SART1O43290 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SART1O43290 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SART1O43290 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SART1O43290 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SART1O43290 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SART1O43290 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SART1O43290 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SART1O43290 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SART1O43290 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SART1O43290 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SART1O43290 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SART1O43290 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SART1O43290 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SART1O43290 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SART1O43290 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SART1O43290 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SART1O43290 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SART1O43290 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SART1O43290 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SART1O43290 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SART1O43290 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SART1O43290 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SART1O43290 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SART1O43290 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SART1O43290 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SART1O43290 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SART1O43290 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SART1O43290 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SART1O43290 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SART1O43290 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SART1O43290 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SART1O43290 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SART1O43290 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SART1O43290 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SART1O43290 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SART1O43290 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SART1O43290 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SART1O43290 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SART1O43290 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SART1O43290 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SART1O43290 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SART1O43290 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SART1O43290 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms