Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC5O15511 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC5O15511 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms