Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MSANTD4-201ENST00000301919 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LRRK2-202ENST00000343742 4740 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 OLFML2A-201ENST00000288815 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RBAK-201ENST00000353796 4125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RNF214-205ENST00000531287 1706 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 C10orf90-201ENST00000284694 3076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZBED9-201ENST00000452236 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.5 ms