Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 LIMK1-201ENST00000336180 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 PRAMEF14-201ENST00000334600 1690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC004951.1-201ENST00000447643 1866 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCAP28676 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 TBC1D3P5-203ENST00000586223 3083 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 NBPF13P-201ENST00000444082 1783 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 LDLR-205ENST00000557933 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 PAAF1-215ENST00000544909 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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GCAP28676 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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GCAP28676 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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GCAP28676 PPP1R26P5-201ENST00000416640 3664 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCAP28676 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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GCAP28676 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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GCAP28676 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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GCAP28676 TRAP1-212ENST00000575671 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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GCAP28676 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCAP28676 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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