Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms