Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R3HCC1Q9Y3T6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms