Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCN4Q9Y3Q4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCN4Q9Y3Q4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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