Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBD1Q9UJT1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBD1Q9UJT1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms