Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N5

RBM27, RNA-binding protein 27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM27Q9P2N5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBM27Q9P2N5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBM27Q9P2N5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBM27Q9P2N5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBM27Q9P2N5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM27Q9P2N5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM27Q9P2N5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms