Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC88CQ9P219 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 937.1 ms