Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RASSF4Q9H2L5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF4Q9H2L5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms