Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTDSP1Q9GZU7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms