Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL4Q9C0H6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL4Q9C0H6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms