Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM5DQ9BY66 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM5DQ9BY66 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5DQ9BY66 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms