Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
HIRIP3Q9BW71 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HIRIP3Q9BW71 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms