Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAF11Q99590 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAF11Q99590 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAF11Q99590 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAF11Q99590 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SCAF11Q99590 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SCAF11Q99590 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms