Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCLT1Q96NL6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms