Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf66Q96MD2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms