Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM63Q969Q1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM63Q969Q1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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