Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFT2D1Q8WV19 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms