Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms