Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNERQ8NFT8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNERQ8NFT8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms