Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP2Q8ND30 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP2Q8ND30 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP2Q8ND30 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP2Q8ND30 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIBP2Q8ND30 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIBP2Q8ND30 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms