Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUQ0

CLVS1, Clavesin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1Q8IUQ0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLVS1Q8IUQ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLVS1Q8IUQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLVS1Q8IUQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLVS1Q8IUQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLVS1Q8IUQ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLVS1Q8IUQ0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLVS1Q8IUQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms