Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
USP43Q70EL4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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