Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC129Q6ZRS4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC129Q6ZRS4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms