Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM20Q6UY09 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM20Q6UY09 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms