Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCN8Q6JVE9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCN8Q6JVE9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCN8Q6JVE9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LCN8Q6JVE9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCN8Q6JVE9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCN8Q6JVE9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCN8Q6JVE9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
LCN8Q6JVE9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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LCN8Q6JVE9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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LCN8Q6JVE9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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LCN8Q6JVE9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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LCN8Q6JVE9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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LCN8Q6JVE9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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LCN8Q6JVE9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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LCN8Q6JVE9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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LCN8Q6JVE9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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LCN8Q6JVE9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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LCN8Q6JVE9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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LCN8Q6JVE9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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LCN8Q6JVE9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
LCN8Q6JVE9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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