Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms