Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms