Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CELF3Q5SZQ8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CELF3Q5SZQ8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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