Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF6Q58WW2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF6Q58WW2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.1 ms