Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC6LQ2NKX8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERCC6LQ2NKX8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms