Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SWI5Q1ZZU3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SWI5Q1ZZU3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SWI5Q1ZZU3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SWI5Q1ZZU3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SWI5Q1ZZU3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SWI5Q1ZZU3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SWI5Q1ZZU3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SWI5Q1ZZU3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SWI5Q1ZZU3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SWI5Q1ZZU3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SWI5Q1ZZU3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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