Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FOXD1Q16676 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
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FOXD1Q16676 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
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FOXD1Q16676 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
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FOXD1Q16676 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
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FOXD1Q16676 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
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FOXD1Q16676 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FOXD1Q16676 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
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